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黑豚鼠的常用藥物主要有抗生素、磺胺藥、抗菌增效劑、消毒防腐藥等。現按藥物名稱、規格、劑量、用法、作用和用途分別介紹如下：
1、青霉素
粉劑20萬單位規格，黑豚鼠每千克體重1萬～2萬單位，主要對多種革蘭氏陽性、陰性細菌、李氏桿菌病、葡萄球菌等有抑殺作用；如果發生呼吸道感染、傳染性肺炎就可使用。具體操作方法是：每千克體重的黑豚鼠用1萬～2萬單位，用注射用水或生理鹽水稀釋，肌肉注射，每天2次。
2.氯霉素
注射劑2毫升(0.259{規格，主要對革蘭氏陽性細菌、陰性細菌作用較強，主要對黑豚鼠急性胃腸炎有治療作用。具體操作方法是：每千克重的黑豚鼠，用30～50毫克，肌肉注射，每天3次。內服片劑，用0.25克規格，每只喂0.1克，每天3次。
3.土霉素
粉劑0.25克規格，主要對革蘭氏陽性、陰性細菌有抑制作用，對黑豚鼠的多種傳染病都有治療作用。具體操作方法是：每千克重的黑豚鼠用20毫克，肌肉注射，每天1～2次。內服粉劑：每只50～120毫克。
4.四環素
粉劑0.25克規格，主要對革蘭氏陽性、陰性細菌有抑制作用，對黑豚鼠的多種傳染病都具有治療作用。具體操作方法是：每千克體重的黑豚鼠用20毫克，用注射水或5葡萄糖液溶解后肌肉注射，每天2次。
5.磺胺噻唑
鈉鹽針劑5毫升：1克規格，主要對革蘭紙陽性、陰性細菌、鏈球菌、沙門氏菌、葡萄球菌有抑制作用，對黑豚鼠多種傳染病，如呼吸道感染、肺炎球菌及肺炎桿菌都有治療作用。此外，對黑豚鼠的濾過性病毒，消化道感染、急性胃腸炎均有療效。具體操作方法：20磺胺鈉注射液，成年黑豚鼠1毫升肌肉注射，早晚各一次。內服片劑：磺胺或磺胺，每次0.2～0.3克口服，每日3～4次，加等量小蘇打。