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水貂尸體剖檢是準確診斷疾病的一個重要手段之一。它不但可以驗證對動物生前疾病的診斷是否正確，還可以對群發性疾病及早作出診斷，及時采取有效的防治措施。
（一）剖檢程序及病理變化
病例剖檢時，要做好各種紀錄，如貂的種類，編號，性別，年齡，死亡時間，臨床診斷，剖檢時間以及各個器官的病理變化等。在剖檢前將尸體體表消毒液潤濕，做好消毒工作。
剖檢的順序是：首先進行外檢，檢查尸體營養狀況，消瘦這可能是慢性疾病死亡；營養良好，肥度適中多見于急性病死亡；口腔，鼻孔，肛門等天然孔出血，可能懷疑是炭疽病；皮膚發炎，增厚，有結節可能是犬瘟熱；因窒息死亡的水貂肌肉成暗紅色，肌肉變性時成蒼白色，無光澤。因敗血型傳染病或中毒死亡的，可見肌肉上有斑狀或點淤血出血點；
其次剖腹檢查，將腹腔打開，若腹腔內有積水，多因慢性腎炎和黃脂肪；如化學藥物中毒，常嗅到一些特殊氣味；腹腔內有出血是中毒和傳染病的表現；腹腔內有糞渣多是胃腸破裂。腹腔內下列臟器也要逐一檢查：
1.脾臟。先檢查脾門淋巴結，觀察脾的長、寬、厚，形態和色澤。一般細菌傳染脾臟增大2-3倍或更大些。如巴氏桿菌病脾呈櫻桃紅色。
2.肝臟。先檢查肝臟大小、被膜的性狀、邊緣的厚薄、實質的硬度和色澤。然后間隔1 cm左右，縱切或橫切開檢查有無膿腫、壞死灶等。肝臟疾病常使肝臟黃染。急性傳染病和中毒性疾病導致肝柔軟，腫大，實質脆弱，切面外翻不平整，肝小葉模糊不清。細菌性傳染病常使肝腫大。
3.腎臟。注意腎臟被膜的緊張和剝離程度。檢查腎臟大小、硬度、表面色澤、平滑度、有無出血點等變化。然后沿外緣中線將腎剖為對稱的兩半，使皮質、髓質及腎盂充分暴露。檢查切面皮質和髓質的色澤、有無淤血、出血、化膿和壞死。如腎表面凹凸不平，呈淡黃色多是慢性阿留申病。
4.胃腸。檢查胃的大小、胃漿膜的色澤、有無粘連和胃壁破裂以及穿孔等。然后將胃自賁門沿大彎剪至幽門，檢查胃內容物的數量、性狀等。最后檢查黏膜的色澤，有無水腫、出血、炎癥和潰瘍等。檢查腸管漿膜的顏色，有無粘連、腫瘤、寄生蟲結節，同時檢查淋巴結的性狀等。先從十二指腸開始剪開腸管，做到邊剪開邊檢查腸內容物的量、性狀、氣味、有無血液、異物、寄生蟲等。去掉腸內容物檢查腸黏膜的性狀，注意黏膜的色澤、厚度和有無炎癥等。如是腸道傳染病、副傷寒、大腸桿菌病、病毒性腸炎等，則胃腸粘膜出血，腸壁便薄。
5.膀胱。查尿液蓄積情況，粘膜有無出血。如尿結石可發現膀胱內有米粒大或豆大的結石顆粒。
再次胸腔檢查，將胸腔打開， 如有胸水，多是心臟或腎臟機能發生問題。有化膿性涌出液，可能是胸膜炎或肺部化膿。胸腔內臟器也要逐一檢查：
1.心臟。首先檢查心臟縱溝、冠狀溝的脂肪量和性狀、心臟的大小、色澤及心外膜有無出血等。然后打開心腔，檢查心內膜色澤、有無出血和變性等。心肌表現為煮肉色，是傳染病或中毒癥狀。
2.肺臟。檢查肺臟的大小、肺胸膜的色澤，用手觸摸各肺葉，檢查有無硬塊、結節和氣腫，并檢查肺淋巴結的性狀。而后用剪刀剪開氣管和支氣管，檢查黏膜的性狀，有無出血和滲出物等。最后將左、右肺葉橫切，檢查切面的色澤和血液量的多少，有無炎性病變、鼻疽結節和寄生蟲結節等。此外還應注意支氣管和間質的變化。必要時可做病變部位的小塊沉浮試驗。氣腫肺漂于水面，正常肺半沉入水中；水腫肺或淤血肺在水下或沉入水中；肺炎肺或無氣腫肺沉入水底。
（二）病理材料的采取和送檢：實體剖檢后，如果診斷仍有疑問，或需要提出詳細材料是，應對各器官進行病理組織學檢查；采取病變部分的組織用10%福爾馬林固定后，送有關獸醫部門檢查。