芝麻苗期發生枯萎病和疫病，每畝可用50%葉枯靈可濕性粉劑0.5公斤，拌濕潤細土20公斤，條施溝底（土壤消毒），然后播種。也可在芝麻苗病初見時畝用25%絡氨銅殺菌劑瑞枯霉25克，兌水40公斤左右，或用硫酸銅800~1000倍液或80%杜邦新萬生800倍液噴霧，每七天一次，連噴2~3次。

芝麻青枯病，在整個生育期均有可能發生。每畝可用20%葉青雙可濕性粉劑50克，或50%多菌靈可濕性粉劑50克，兌水50公斤左右，噴霧。如點片發病明顯，可改用藥液灌蔸，效果更佳。發病初期用綠亨1號3000倍液灌根效果很理想。

芝麻莖點枯病，在其生長后期發病更嚴重，每畝可用50%多菌靈可濕性粉劑50克，或綠亨7號500~700倍，或70%甲基托布津可濕性粉劑60克，兌水50公斤左右噴霧。

芝麻螟蛾，在初花期至收獲前均有發生，但在盛莢期較多，為害重。可掌握幼蟲盛發期，畝用3%凱歐2~3包，或用90%敵百蟲800~1000倍液，每畝噴藥液50公斤左右。

芝麻天蛾，在中后期發生多，可抓住幼蟲盛發期，畝用3%凱歐2~3包或用90%敵百蟲800~1000倍液，或80%敵敵畏乳劑1500倍液，每畝噴藥液50公斤。